Embora você possa simplesmente copiar os arquivos armazenados no pendrive para outro local para fazer o backup do pendrive, essa opção pode não ser muito prática se você possui muitos arquivos e programas no pendrive, uma vez que se precisar formatar o pendrive, precisará restaurá-los um a um.
A melhor opção nesse caso pode ser criar uma imagem do pendrive, que lhe permitirá restaurar todos os arquivos do pendrive rapidamente sem que você precise ficar copiando os arquivos um a um. Veja nesse tutorial como fazer o backup completo do pendrive criando uma imagem (clone) do dispositivo.

Como criar uma imagem de backup do pendrive
Para criar uma imagem de backup do pendrive, nós vamos usar o programa ImageUSB da PassMark Software, que é um programa gratuito, portátil, e que suporta todas as versões recentes do Windows.
1. Baixe o programa ImageUSB e extraia o arquivo ZIP para uma pasta qualquer.
2. Em seguida, clique duas vezes no arquivo imageUSB.exe e aguarde o ImageUSB ser aberto.
3. Com o Image USB aberto, selecione o pendrive que deseja fazer o backup no passo 1 (Step 1)
4. No passo 2 (Step 2), selecione a opção “Create image from USB drive”
5. No passo 3 (Step 3) clique no botão “Browse”, selecione a pasta onde deseja salvar a imagem de backup do pendrive, defina o nome para salvar o arquivo de backup do pendrive e clique em “Salvar”.
6. Por fim, clique no botão “Create” para criar a imagem de backup do pendrive. Uma mensagem de confirmação será exibida, clique no botão “Yes” para confirmar a criação de um backup do pendrive.
7. Pronto, agora basta aguardar o backup ser realizado. O arquivo de backup terá o mesmo tamanho da capacidade de armazenamento total do pendrive. Por exemplo, se o pendrive tem 8 GB, o backup terá 8 GB, mesmo quando o “espaço de armazenamento do pendrive” não estiver totalmente em uso.
Como restaurar a imagem de backup do pendrive
Restaurar um backup de um pendrive é tão simples quanto criar uma imagem de backup. Basta você seguir as instruções abaixo para restaurar rapidamente uma imagem de backup para o seu pendrive.
1. Execute o Image USB e selecione no passo 1, o pendrive para o qual deseja restaurar o backup.
2. Selecione a opção “Write Image to USB to USB Drive” no passo 2.
3. No passo 3, selecione o arquivo de backup
4. Clique em “Write” para restaurar a imagem de backup do pendrive. Na mensagem de confirmação exibida, clique em “Yes” para confirmar que deseja restaurar o backup e depois clique no botão “Sim” para confirmar que você está ciente de que os arquivos que estõ salvos no pendrive serão perdidos.
5. Pronto, agora basta aguardar ele restaurar a imagem de backup no pendrive.